На wordpress, если виджет установлен плагином индексация, будет работать по умолчанию. В остальных же случаях потребуются манипуляции с API. Как и любые внешние системы комментирования, Tolstoy Comments работает через iframe, поэтому для индексации поисковиками сначала комментарии из виджета нужно сохранить в свою локальную базу данных и отрисовать на html-страницах. Читайте подробную инструкцию, как это сделать. Там же консультируем в комментариях.